L’aumônerie catholique de l’Université de Toamasina existe depuis 1985. Elle est responsable de l’éducation pastorale des étudiants catholiques. Ceci inclut : prêcher l’Evangile aux étudiants, les aider à vivre avec foi les devoirs pour lesquels Dieu les a appelés.
L’aumônerie dispose d’un foyer appelé Ny akany soa navela situé près de l’Université. On y trouve une chapelle une salle de lecture, une bibliothèque et le bureau de l’aumônier.